為了減輕對進口石油的依賴，國際間無不鼓勵生質燃料的開發。但生質燃料對物價、環境等等的影響正在侵蝕它所能帶來的利益。如果缺乏周詳的計畫和國際間的合作，一味的追求反而可能造成更多的問題。
什麼是生質能源？
生質燃料產自可再生的原料（動物或植物），主要分為兩種：乙醇，市佔率約78%，以甘蔗、甜菜、玉米、小麥或其他穀類為原料；其餘市場則由生質柴油佔有，以棕櫚油、大豆、油菜籽、向日葵籽、動物脂肪等原料。
最大的乙醇製造國美國（玉米）及巴西（甘蔗）的原料皆來自國內，歐洲則為生質柴油最大的生產區域，目前其原料對進口的依賴正逐漸增加。去年美國、巴西及歐洲生質燃料的產量約佔全世界的95%。
生質燃料不只因為製造成本高，其效率也低於石油燃料，所以必須依賴政府的支持以開發市場。其運輸成本也較為昂貴；生質柴油容易溫下變質，乙醇則需要裝在特殊的容器以避免混入水或雜質。因此，只有當國際油價高漲而生質燃料成本相對低廉時，這項新工業才可能出頭。
多數國家是為了提供國內消費而支持生質燃料，而以高關稅保護國內工業。在高關稅保護政策下，只有約十分之一的生質燃料在國際間交易（其中一半來自巴西）。當國際間生質燃料的市場逐漸成熟，非生產國的愈來愈仰賴進口，生質燃料工業的繁榮有賴貿易的自由化。
當燃料還是當食物？
生質燃料工業成長對農產品價格的影響無可避免，也引起了「燃料 vs. 食物」的激辯。
生質燃料的產能擴增而提高了對原料的需求，已使得食品價格高度膨乾旱及欠收又加重了供需失衡，世界銀行估計約有一半的價格上漲起因於美國對玉米製乙醇的消費。目前美國生質燃料工業消耗國內玉米收成的四分之一，嚴重地排擠了食物的消費。
但生質燃料對物價的衝擊並不僅止於其原料。農產品間的價格連動關係非常強：農民改生產收益較高的生質燃料作物，使得其餘農產品供應下降、價格上揚；而一但用作飼料的農產價格上升，亦將促使肉類及乳製品的價格上升。生質燃料原料的需求提高的同時，全球對糧食的需求也急劇上升，使農產品價格上漲的壓力更加強大。聯合國糧食及農業組織（FAO）估計2007年生質燃料的價格將上升13%並且在2008年持續上升，而今年開發中國家的糧食進口花費則上升了9%。
真的環保嗎？
生質燃料被認為可以減少碳的排放量，因為在原料生長的過程中會吸收二氧化碳排出氧氣。同時乙醇燃燒時排出的廢氣亦是所有燃料中最為乾淨的一種。
但是在許多情況中，生質燃料在製造過程中所產生的二氧化碳，甚至超過原料在生長時所能吸收：美國境內以玉米生產乙醇時通常以煤做為電力供應，使得排碳量增加；依照製程的不同，以大豆生產乙醇時所排放的碳則為石化燃料3/4至2倍間。
為了能達到各國政府所設定的目標，在接下來的十年內，用做生產生質燃料原料的土地勢必大量增加，即使一部分的土地將自生產糧食或紡織品轉換而來，仍然難以避免開發新農地的誘因，導致大量的森林砍伐，特別是在保護規定缺乏的非洲國家。
拉丁美洲和東南亞已經出現上述砍伐森林的情況。例如印尼即砍伐原始雨林，生產棕櫚油以製造生質柴油。此外，增加種植也意味消耗更多的水及土壤，更進一步地將影響整個環境。
結論
即使有著諸多質疑，投資人仍會對於生質燃料保有高度興趣。其產量預定在2012年前每年提升20%，而油價、環保壓力及能源保障都仍將是推動成長重要因素。美國總統布希期待在十年內，用生質燃料取代20%的石油使用量，以減少對石化燃料及中東地區的依賴。歐盟執行委員會則因擔憂氣候變遷，預計在2020年時，十分之一的道路運輸採用生質燃料。
為了減少生產生質燃料對糧食價格及環境的衝擊，相較於轉換原有農地生產原料，應該自有生產優勢的熱帶國家進口生質燃料。巴西擁有全世界最有效率的生質燃料工業，但卻面臨著美國的高關稅壁壘。聯合國糧食及農業組織已要求美國及歐盟降低關稅，並協助開發中國家生產生質燃料，特別是以麻瘋樹、生物質量或廢棄物為原料的生質燃料。
若上述手段皆能有效執行將有助於控制生產成本，也能使生質燃料工業得以自立，不必再仰賴政府的支持。
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